העשייה החקלאית מייצרת לעיתים גורמי זיהום המהווים מטרד בחלקה עצמה או לסביבה. בנוסף, החקלאות צורכת בין היתר מוצרים שמקורם במטרדים שונים.
נבטים עוסקת בהכוונת פעילות אגרוטכנית למיזעור גורמי זיהום כגון: דישון לפי צרכי הצמח להקטנת פליטת מזהמים, יישום תוספים אורגניים באופן שיבטיח ניצול מיטבי של הצמח ומינימום הדחה של מזינים לתת הקרקע.
בתחום הגנת הצומח: הדברה משולבת – IPM, טיפול מושכל בהדברת עשבייה.
